اداره کل امور دانشجویان داخل یکی از ادارات کل زیرمجموعه معاونت امور دانشجویان داخل در سازمان است که با توجه به ماموریت‌هایی که به این اداره کل داده شده است در زمینه های آموزشی، رفاهی و انضباطی خدمات مختلفی را به دانشجویان داخل کشور ارائه می‌دهد و یکی از مهمترین ادارات کل در سازمان است كه با گستردگی حوزه فعالیت که با مراجعین مختلف (دانشجویان و دانش‌آموختگان، والدین آن‌ها، کارکنان دانشگاه‌ها و موسسات آموزش عالی و اعضا محترم هیات علمی) ارتباط نزدیک و مداوم دارد. 
از مهمترین رسالت‌ها و ماموریت‌های اداره کل امور دانشجویان داخل ایجاد بستر مناسب در داخل کشور جهت تحصیل دانشجویان و ایجاد هماهنگی در ارائه خدمات آموزشی به دانشجویان و دانش‌آموختگان، شناسایی و پرورش استعدادهای ویژه در دانشگاه‌های سراسر کشور با انتخاب دانشجویان نمونه و مهارتی کشوری، فراهم نمودن مشارکت دانشجویان در امور صنفی و رفاهی با تشکیل شوراهای صنفی در دانشگاه‌ها، مقابله با تهدیدها و عوامل آسیب‌زای اخلاقی و اجتماعی در حوزه‌های دانشجویی با تشکیل شورای انضباطی که دارای رویکرد پرورش و تربیتی و صیانت از جایگاه دانشگاه است، می باشد.